ศูนย์เมล็ดพันธุ์ข้าวชลบุรี จัดตั้งขึ้นตามโครงการผลิตและขยายพันธุ์พืชภายใต้เงินกู้จากประเทศญี่ปุ่น(OECF)เมื่อ ปี พ.ศ. 2529 เพื่อแก้ไขปัญหาการขาดแคลนเมล็ดพันธุ์ของเกษตรกร และเพื่อให้เกษตรกรได้ใช้เมล็ดพันธุ์ดี เดิมชื่อศูนย์ขยายพันธุ์พืชที่ 19 จังหวัดชลบุรี เมื่อปี พ.ศ. 2546 ได้เปลี่ยนเป็นศูนย์ขยายเมล็ดพันธุ์พืชที่ 19 จังหวัดชลบุรี และต่อมาเมื่อวันที่ 16 มีนาคม 2549 เปลี่ยนเป็นศูนย์เมล็ดพันธุ์ข้าวชลบุรี สังกัดสำนักเมล็ดพันธุ์ข้าว กรมการข้าว โดยมีเป้าหมายการผลิตเมล็ดพันธุ์ข้าวรวม ปีละประมาณ 4,000 ตัน
การบริหารงานของศูนย์เมล็ดพันธุ์ข้าวชลบุรี
มีข้าราชการ 13 ลูกจ้างประจำ 13 คน และพนักงานราชการเงินทุนหมุนเวียน 1 คน
การบริหารงาน ดังนี้
1. ฝ่ายบริหารทั่วไป
2. กลุ่มผลิตเมล็ดพันธุ์
3.
กลุ่มควบคุมคุณภาพ
4.
กลุ่มพัฒนาธุรกิจเมล็ดพันธุ์
5.
กลุ่มถ่ายทอดวิทยาการเมล็ดพันธุ์ดี